对德意志而言，《吕内维尔和约》的最大历史后果在于，它从根本上改变甚至摧毁了帝国的原有结构，帝国的领土和政治状况发生巨大变化。首先，由于大量领土的丧失，原先寄生于其上的许多邦国和帝国等级（Reichsstnde）因此而消失；其次，和约规定，丧失莱茵河西岸土地以及放弃意大利托斯卡纳等地区的德意志诸侯和等级要在德意志境内得到相应补偿，这意味着帝国必须为此调整原有领地划分，依托于领地的政治力量格局也将随之发生改变。因此，古老的德意志民族的神圣罗马帝国的丧钟敲响了。
二、德意志与拿破仑帝国时期的反法联盟战争
（一）第三次联盟战争与《普雷斯堡和约》
《亚眠和约》只是给欧洲带来了暂时和平。从法国方面看，军事上的胜利巩固了拿破仑的地位，其个人政治野心因此迅速膨胀。他对内加强中央集权，于1802年8月成为终身执政官，1804年12月2日又加冕称帝，建立法兰西帝国（Franzsisches Reich；Kaiserreich Frankreich） ，即第一帝国（Erstes Kaiserreich，1804—1814/15）。与此同时，他在对外方面采取肆无忌惮的大陆扩张政策。《亚眠和约》后，他相继将意大利的皮蒙特、帕尔马并入法国，并且占领了瑞士。在德意志地区，他大力拉拢巴伐利亚、符滕堡和巴登等南德各邦国，将自己的影响力扩张到莱茵河东岸地区。这些举动使整个欧洲为之震惊。此外，为了防止波旁王朝复辟，他派兵进入巴登，把波旁王朝的后裔昂吉安公爵（Louis Antoine Henride Bourbon，Herzog von Enghien，1772—1804）捉回法国处死。于是，在欧洲各国宫廷的眼中，拿破仑成了可怕的“科西嘉怪物”。