这就打破了认为法相和唯识是一种学的传统观念。欧阳渐的看法得到了一些人的赞同，如章太炎就评价说：“谓其识足以独步千祀”。
对于中国传统佛学精华所在的禅、天台、贤首（华严）宗，欧阳渐则提出了批评。指出中国的禅宗已非印度的法理严密的禅学，中国禅宗动辄主张废弃文字，置经论于不顾，只为口头禅，导致了佛法真义逐渐隐没不彰。他对天台、贤首两宗，则进行了根本否定，其方式，是先断析两宗的理论依据《楞严经》和《大乘起信论》是“伪说”，然后再顺理成章地否定两宗。他说：“贤首、天台欲成法界一乘之动，而义根《起信》，反窃据于外魔。盖性体智用樊乱淆然，乌乎正法？”[27]并认为唐代唯识学已将这两宗斥破，“一切霾阴荡涤尽”，人们更不应该相信两宗的伪说。
欧阳渐的大弟子吕澂撰文指出，天台、贤首两宗主要的伪说是“性觉说”，而实际上，佛教真正的本义是“性觉说”[28]。他还认为，中国传统佛学禅、天台、华严、净土、密宗都是建立在这种错误的“性觉说”基础上的，因而都没有多大价值。“我国佛法自奘师一系中绝以来，正统沉沦，经千余载。其间虽然禅密台净之继起而盛，然于佛法精神背驰日远”。